Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Mirlet7c-1-201ENSMUST00000083623 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm22597-201ENSMUST00000157602 80 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Zbed3Q9D0L1 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm43582-201ENSMUST00000196149 343 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Olfr733-201ENSMUST00000163469 994 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Zbed3Q9D0L1 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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