Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm23777-201ENSMUST00000158994 259 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm28189-201ENSMUST00000190085 571 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Tas2r123-201ENSMUST00000071696 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Vmn1r29-202ENSMUST00000226971 4714 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Zfp846-201ENSMUST00000060063 1626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm25404-201ENSMUST00000082970 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm28474-201ENSMUST00000188501 315 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc47Q9D024 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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