Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm44754-201ENSMUST00000208155 400 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm25156-201ENSMUST00000179809 79 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm45344-201ENSMUST00000211610 341 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm10801-201ENSMUST00000099684 504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Mir7679-201ENSMUST00000183379 63 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm22862-201ENSMUST00000178593 121 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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