Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Rny3-201ENSMUST00000083011 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm23223-201ENSMUST00000158119 127 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Ctu1Q99J10 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms