Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Tmsb15b2-202ENSMUST00000180194 243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm23738-201ENSMUST00000082828 171 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm24291-201ENSMUST00000157633 162 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm10264-201ENSMUST00000220589 429 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Atg4cQ811C2 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC3.03□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm25848-201ENSMUST00000116790 144 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm14821-201ENSMUST00000121975 435 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Atg4cQ811C2 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 339.3 ms