Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm23617-201ENSMUST00000175410 95 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm23672-201ENSMUST00000157471 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm10038-201ENSMUST00000077233 441 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm24372-201ENSMUST00000104400 110 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm43407-201ENSMUST00000199816 317 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm24018-201ENSMUST00000083232 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC0.42□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.41□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC0.4□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm13941-201ENSMUST00000127918 736 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm24401-201ENSMUST00000157868 91 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC0.4□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Sprr1b-201ENSMUST00000062160 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.34
Cnot1Q6ZQ08 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.4□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Mir6915-201ENSMUST00000198839 69 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
Cnot1Q6ZQ08 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC0.39□□□□□ -2.35
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