Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Mir216a-201ENSMUST00000083605 72 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm27415-201ENSMUST00000183720 95 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm26152-201ENSMUST00000157427 101 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm23455-201ENSMUST00000083331 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm13672-201ENSMUST00000117554 459 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Rpl39-ps-202ENSMUST00000146505 151 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm22446-201ENSMUST00000180108 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Mir710-201ENSMUST00000102088 110 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
NipblQ6KCD5 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm25032-201ENSMUST00000175411 84 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Mir672-201ENSMUST00000102331 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm13440-201ENSMUST00000121665 496 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm22942-201ENSMUST00000158563 124 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 AC165437.1-201ENSMUST00000228640 536 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm14917-201ENSMUST00000118872 2105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm27762-201ENSMUST00000183417 109 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Gm24927-201ENSMUST00000083397 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
NipblQ6KCD5 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
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