| Hoxa13 | Q62424 | AF357428-201 | ENSMUST00000083815 | 69 nt | BASIC | 3.65 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | A230057D06Rik-202 | ENSMUST00000207061 | 3717 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.65 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm43875-201 | ENSMUST00000203319 | 2475 nt | BASIC | 3.65 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Nexn-211 | ENSMUST00000199423 | 2016 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.65 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm14288-201 | ENSMUST00000109020 | 3438 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.64 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Zfp970-202 | ENSMUST00000108952 | 1569 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.64 | □□□□□ -1.83 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Gm8840-201 | ENSMUST00000122454 | 386 nt | BASIC | 3.63 | □□□□□ -1.83 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Gm23148-201 | ENSMUST00000180367 | 107 nt | BASIC | 3.63 | □□□□□ -1.83 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | AC164297.1-201 | ENSMUST00000224484 | 1561 nt | BASIC | 3.63 | □□□□□ -1.83 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Csn1s2b-202 | ENSMUST00000101057 | 1668 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | 1700008H02Rik-201 | ENSMUST00000201220 | 1684 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Ighv1-46-201 | ENSMUST00000193988 | 351 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Gm45317-201 | ENSMUST00000210385 | 223 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Gm9696-201 | ENSMUST00000094227 | 3050 nt | TSL 2 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Olfr1097-201 | ENSMUST00000111576 | 4705 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm18337-201 | ENSMUST00000219023 | 5762 nt | BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
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| Hoxa13 | Q62424 | Mgat4c-212 | ENSMUST00000179929 | 4272 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | D3Ertd254e-201 | ENSMUST00000165956 | 6503 nt | TSL 3 BASIC | 3.62 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm32014-201 | ENSMUST00000214779 | 5145 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Sacs-203 | ENSMUST00000119943 | 14991 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm37158-201 | ENSMUST00000191652 | 5704 nt | BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Igkv8-16-201 | ENSMUST00000103392 | 362 nt | APPRIS ALT2 BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Trav16-201 | ENSMUST00000103667 | 420 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm13714-201 | ENSMUST00000117313 | 221 nt | BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gtpbp4-ps4-201 | ENSMUST00000184813 | 258 nt | BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm13266-203 | ENSMUST00000193364 | 421 nt | TSL 3 BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | 4930431L21Rik-202 | ENSMUST00000200253 | 624 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Olfr797-ps1-201 | ENSMUST00000203614 | 415 nt | BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Olfr542-ps1-201 | ENSMUST00000211706 | 831 nt | BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm10139-201 | ENSMUST00000081471 | 171 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |
| Hoxa13 | Q62424 | Gm23136-201 | ENSMUST00000083425 | 99 nt | BASIC | 3.61 | □□□□□ -1.83 | | |