Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm25105-201ENSMUST00000122477 130 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Zfp131-202ENSMUST00000178271 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm27535-201ENSMUST00000183814 157 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm28828-201ENSMUST00000186601 696 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm28563-201ENSMUST00000201179 211 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm44525-201ENSMUST00000183129 2634 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Olfr733-203ENSMUST00000214756 3640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm25805-201ENSMUST00000122788 108 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Tcrg-V4-201ENSMUST00000103554 426 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Rhoay-ps1-201ENSMUST00000191243 581 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Zfp945-205ENSMUST00000160457 6497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm13355-201ENSMUST00000117996 317 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm14416-201ENSMUST00000118630 2308 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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ptchd1Q14B62 Gm26200-201ENSMUST00000180273 79 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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ptchd1Q14B62 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 AC153979.1-201ENSMUST00000219684 242 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 AC123035.1-201ENSMUST00000213846 2671 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ptchd1Q14B62 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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