Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 4930524B17Rik-201ENSMUST00000200755 1870 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Olfr726-204ENSMUST00000215105 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm16533-201ENSMUST00000140035 228 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm25054-201ENSMUST00000157370 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm38050-201ENSMUST00000191904 238 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm43510-201ENSMUST00000197922 353 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm25476-201ENSMUST00000175125 185 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Hoxc11P31313 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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