Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Mir3473a-201ENSMUST00000175011 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Snord116l5-201ENSMUST00000179927 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PtprmP28828 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PtprmP28828 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm23924-201ENSMUST00000082474 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm12694-201ENSMUST00000149367 748 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
PtprmP28828 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PtprmP28828 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Mir151-201ENSMUST00000083678 68 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm15126-201ENSMUST00000118631 833 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PtprmP28828 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm26275-201ENSMUST00000157101 268 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PtprmP28828 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
PtprmP28828 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PtprmP28828 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
PtprmP28828 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm46367-202ENSMUST00000222771 501 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC1□□□□□ -2.25
PtprmP28828 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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