Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm19777-201ENSMUST00000191940 358 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm34073-201ENSMUST00000195736 212 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm7582-201ENSMUST00000160831 603 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 mt-Co3-201ENSMUST00000082409 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm25121-201ENSMUST00000179846 79 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RxraP28700 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RxraP28700 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RxraP28700 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RxraP28700 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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