Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
Pdzd2E9Q1M1 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm25905-201ENSMUST00000158490 101 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC0.21□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm44137-201ENSMUST00000203670 367 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm24805-201ENSMUST00000082931 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm26051-201ENSMUST00000104642 93 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 n-R5s155-201ENSMUST00000122531 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm23907-201ENSMUST00000104595 189 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm25429-201ENSMUST00000157607 132 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm22298-201ENSMUST00000082662 133 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Olfr821-203ENSMUST00000214177 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Trbv12-3-201ENSMUST00000192675 372 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm25652-201ENSMUST00000083780 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm10974-201ENSMUST00000107486 126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm8633-201ENSMUST00000218457 558 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Traj29-201ENSMUST00000103712 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Olfr774-202ENSMUST00000203248 1429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm26213-201ENSMUST00000158582 110 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm24203-201ENSMUST00000082949 114 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm22013-201ENSMUST00000158788 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Scgb1b8-ps-201ENSMUST00000189652 249 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 Gm44469-201ENSMUST00000198558 79 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
Pdzd2E9Q1M1 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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