Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm27786-201ENSMUST00000184337 70 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm37807-201ENSMUST00000194310 190 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Olfr1193-202ENSMUST00000213893 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm13136-201ENSMUST00000121031 2950 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm11285-201ENSMUST00000118443 322 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms