Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
Rtf1A2AQ19 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Olfr1543-ps1-201ENSMUST00000217448 908 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Mir6341-201ENSMUST00000183490 121 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Olfr241-ps1-201ENSMUST00000197024 633 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm43512-201ENSMUST00000198495 176 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Rtf1A2AQ19 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms