Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Slc5a12-201ENSMUST00000045972 3529 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Limd1Q9QXD8 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Steap2-204ENSMUST00000115426 10408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm20515-201ENSMUST00000174440 4824 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Olfr836-203ENSMUST00000215981 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm14124-201ENSMUST00000109922 3018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Trim30d-202ENSMUST00000071069 3282 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Fat3-205ENSMUST00000217308 18760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 AC153801.2-201ENSMUST00000219875 3372 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm22398-201ENSMUST00000174941 125 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm25731-201ENSMUST00000175167 125 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm29668-201ENSMUST00000187802 315 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Cdh12-203ENSMUST00000227496 6004 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Hmcn1-201ENSMUST00000074783 17908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Fam169a-202ENSMUST00000169863 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Macf1-201ENSMUST00000082108 17331 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Fscb-201ENSMUST00000059833 3361 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm22120-201ENSMUST00000175590 70 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 5330437M03Rik-201ENSMUST00000201318 4083 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Olfr393-202ENSMUST00000213365 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Olfr1446-203ENSMUST00000216805 2417 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Limd1Q9QXD8 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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