Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm20689-201ENSMUST00000176033 279 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm22199-201ENSMUST00000122660 126 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm16326-201ENSMUST00000162843 414 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Olfr24-203ENSMUST00000216754 4327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Il6st-202ENSMUST00000183513 201 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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