Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm5548-201ENSMUST00000055878 397 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm27465-201ENSMUST00000184290 91 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Mir129b-201ENSMUST00000197461 65 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 AC154636.2-201ENSMUST00000222538 161 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Pak3-201ENSMUST00000033640 8348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Adgre4-201ENSMUST00000025004 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 AC124562.2-201ENSMUST00000223888 2313 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm25538-201ENSMUST00000101943 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm13478-201ENSMUST00000118312 413 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm24739-201ENSMUST00000158855 292 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Olfr1277-202ENSMUST00000214760 5944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm37624-201ENSMUST00000193751 219 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm6176-202ENSMUST00000207633 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 CT010444.1-201ENSMUST00000219963 3845 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 CT030242.2-201ENSMUST00000221588 148 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm26204-201ENSMUST00000082906 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Snora31-201ENSMUST00000083213 130 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Olfr1251-201ENSMUST00000214304 3133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm25999-201ENSMUST00000175398 133 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Rabgef1Q9JM13 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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