Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm23221-201ENSMUST00000158118 93 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm2855-201ENSMUST00000166765 456 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm28453-203ENSMUST00000187041 189 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm17991-201ENSMUST00000208139 297 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm24394-201ENSMUST00000158141 123 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Cldn12Q9ET43 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms