Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm29073-201ENSMUST00000185563 664 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm29165-201ENSMUST00000190655 664 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm30239-202ENSMUST00000223193 631 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1183-201ENSMUST00000102618 912 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm21827-201ENSMUST00000178247 423 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Olfr927-ps1-201ENSMUST00000216759 782 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Rprd1bQ9CSU0 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm27013-202ENSMUST00000205067 1436 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Gm22997-201ENSMUST00000082845 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Rprd1bQ9CSU0 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.8 ms