Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm45540-201ENSMUST00000209271 3606 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm21034-201ENSMUST00000207390 2608 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Mir291a-201ENSMUST00000104815 82 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm25956-201ENSMUST00000175115 217 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm28288-201ENSMUST00000191019 214 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm32817-202ENSMUST00000210738 527 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm22245-201ENSMUST00000082479 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Vmn1r45-208ENSMUST00000228662 3309 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Trav5d-2-201ENSMUST00000196107 275 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Trav5n-2-201ENSMUST00000197136 275 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Trav16-201ENSMUST00000103667 420 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm13314-201ENSMUST00000118742 335 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Apobec3Q99J72 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
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