Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm5483-201ENSMUST00000114858 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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Atg4aQ8C9S8 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm24275-201ENSMUST00000116780 146 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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Atg4aQ8C9S8 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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Atg4aQ8C9S8 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
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Atg4aQ8C9S8 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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Atg4aQ8C9S8 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Atg4aQ8C9S8 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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