Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm7654-201ENSMUST00000186738 683 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rbbp4Q60972 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rbbp4Q60972 Olfr138-203ENSMUST00000173841 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rbbp4Q60972 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rbbp4Q60972 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rbbp4Q60972 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rbbp4Q60972 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rbbp4Q60972 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rbbp4Q60972 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rbbp4Q60972 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rbbp4Q60972 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rbbp4Q60972 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Rbbp4Q60972 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rbbp4Q60972 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Rbbp4Q60972 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.8 ms