Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Zfp972-203ENSMUST00000108986 192 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm22768-201ENSMUST00000158366 153 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm21858-202ENSMUST00000185713 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Snora41-201ENSMUST00000082668 132 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Mir7675-201ENSMUST00000184262 58 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1005-ps1-201ENSMUST00000216207 488 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 CT025689.3-201ENSMUST00000223817 301 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.61□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
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