Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC129202.2-201ENSMUST00000225123 177 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Mir181a-1-201ENSMUST00000083631 87 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm42785-201ENSMUST00000202316 3835 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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