Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm5358-201ENSMUST00000212814 353 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 AC136976.1-201ENSMUST00000221440 381 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm22868-201ENSMUST00000083955 164 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Olfr1116-202ENSMUST00000216364 9655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Mir6938-201ENSMUST00000184173 63 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm34779-201ENSMUST00000210036 263 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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ptchd1Q14B62 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Cfh-206ENSMUST00000192880 3746 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm23063-201ENSMUST00000102350 93 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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ptchd1Q14B62 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 2410024N13Rik-201ENSMUST00000090704 669 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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ptchd1Q14B62 Olfr125-202ENSMUST00000213857 3835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Olfr548-ps1-202ENSMUST00000210064 4287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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ptchd1Q14B62 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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ptchd1Q14B62 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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ptchd1Q14B62 AC113291.1-201ENSMUST00000217557 403 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
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ptchd1Q14B62 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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ptchd1Q14B62 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm3443-201ENSMUST00000112772 285 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm11704-201ENSMUST00000120031 214 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms