Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm44084-201ENSMUST00000203947 409 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm24316-201ENSMUST00000083041 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Zfp62-212ENSMUST00000180016 3964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Olfr1030-201ENSMUST00000056849 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm12693-201ENSMUST00000121965 483 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm27521-201ENSMUST00000184022 64 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm15302-201ENSMUST00000117779 2630 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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Hoxd1Q01822 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm12647-201ENSMUST00000118977 265 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Igkv2-113-201ENSMUST00000196138 362 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm10222-201ENSMUST00000088336 294 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Hoxd1Q01822 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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