Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 A730009L09Rik-202ENSMUST00000210306 201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm31294-201ENSMUST00000211216 138 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm13432-201ENSMUST00000118861 241 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm25992-201ENSMUST00000102437 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm17154-201ENSMUST00000165748 431 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm26437-201ENSMUST00000082595 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm22723-201ENSMUST00000083820 129 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 AC133517.1-203ENSMUST00000225570 390 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Rpl28P41105 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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