Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
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PtprmP28828 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
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PtprmP28828 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm29211-201ENSMUST00000191470 664 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
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PtprmP28828 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm19147-201ENSMUST00000199622 652 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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PtprmP28828 Gm45590-201ENSMUST00000209715 262 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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PtprmP28828 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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PtprmP28828 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm11359-201ENSMUST00000120039 567 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
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PtprmP28828 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
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PtprmP28828 Gm20594-201ENSMUST00000179797 449 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PtprmP28828 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PtprmP28828 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 n-R5s189-201ENSMUST00000122675 114 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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PtprmP28828 1700010N08Rik-201ENSMUST00000187456 189 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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PtprmP28828 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PtprmP28828 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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