Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RxraP28700 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RxraP28700 Olfr609-202ENSMUST00000216075 3429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm23933-201ENSMUST00000178405 79 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RxraP28700 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm20651-201ENSMUST00000177219 329 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Olfr110-201ENSMUST00000168318 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RxraP28700 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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