Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm37645-201ENSMUST00000194285 3556 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm17187-201ENSMUST00000164622 410 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm38361-201ENSMUST00000193419 458 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Olfr1270-204ENSMUST00000215975 4854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm16358-201ENSMUST00000146046 210 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm25486-201ENSMUST00000158726 63 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Olfr1304-ps1-201ENSMUST00000208032 189 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm6615-201ENSMUST00000199426 631 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm13396-201ENSMUST00000120617 271 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm27926-201ENSMUST00000157180 66 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm10337-201ENSMUST00000096145 165 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cbx4O55187 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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