Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm12858-201ENSMUST00000121913 208 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm24501-201ENSMUST00000158452 62 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 AC126267.1-201ENSMUST00000214282 284 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Olfr652-202ENSMUST00000215410 4672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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Nedd9O35177 Gm23234-201ENSMUST00000157304 134 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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Nedd9O35177 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Scgb2b2-202ENSMUST00000205821 357 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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Nedd9O35177 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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Nedd9O35177 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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Nedd9O35177 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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Nedd9O35177 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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Nedd9O35177 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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Nedd9O35177 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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Nedd9O35177 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Nedd9O35177 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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