Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Eftud2O08810 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Eftud2O08810 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Eftud2O08810 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Eftud2O08810 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Eftud2O08810 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm43513-201ENSMUST00000199779 1076 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm12550-201ENSMUST00000118478 329 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm25658-201ENSMUST00000158472 128 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Eftud2O08810 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms