Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm37239-201ENSMUST00000193510 141 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.73
Spocd1B1ASB6 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm37672-201ENSMUST00000192682 4014 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Olfr1277-202ENSMUST00000214760 5944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Nlrp4c-201ENSMUST00000037728 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm17166-201ENSMUST00000172006 431 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Spocd1B1ASB6 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.9 ms