Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 AC126440.1-201ENSMUST00000227098 349 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Rhox11-ps2-201ENSMUST00000117962 451 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 AC115291.1-201ENSMUST00000226803 258 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm43976-201ENSMUST00000203637 235 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm44687-201ENSMUST00000204975 235 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Grik3B1AS29 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm37054-201ENSMUST00000193481 543 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 CT009504.1-201ENSMUST00000218252 3330 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm15561-201ENSMUST00000124326 540 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Grik3B1AS29 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.1 ms