Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Ighv1-68-201ENSMUST00000198789 294 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 AC102352.1-201ENSMUST00000224187 582 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm14770-201ENSMUST00000122197 312 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm25488-201ENSMUST00000158728 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 CT025689.4-201ENSMUST00000225926 601 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Atp8b5A3FIN4 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181 ms