Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gpr174-207ENSMUST00000178838 4955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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Cln8Q9QUK3 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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Cln8Q9QUK3 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
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Cln8Q9QUK3 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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Cln8Q9QUK3 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Cln8Q9QUK3 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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Cln8Q9QUK3 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
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Cln8Q9QUK3 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm13565-201ENSMUST00000133596 700 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm27220-201ENSMUST00000183453 262 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Cln8Q9QUK3 AC124104.1-201ENSMUST00000226279 417 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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