Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Traj37-201ENSMUST00000103705 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm26026-201ENSMUST00000122726 123 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Mir7047-201ENSMUST00000184595 64 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm28627-201ENSMUST00000186141 453 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 AC134860.6-201ENSMUST00000226038 285 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm13762-201ENSMUST00000144908 2612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r46-204ENSMUST00000228231 13338 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Obscn-203ENSMUST00000052872 23006 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm4788-203ENSMUST00000111989 3187 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Rps15a-ps7-201ENSMUST00000117430 392 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm22986-201ENSMUST00000122753 130 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r18-202ENSMUST00000228574 14315 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Olfr109-204ENSMUST00000217602 5437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Olfr815-202ENSMUST00000216182 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Cngb3-201ENSMUST00000102999 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Vwc2l-203ENSMUST00000161937 4323 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm22316-201ENSMUST00000158012 216 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm23209-201ENSMUST00000158667 110 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm44354-201ENSMUST00000196017 143 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm24356-201ENSMUST00000082859 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm24204-201ENSMUST00000082950 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm25581-201ENSMUST00000083410 164 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Olfr1323-203ENSMUST00000213556 5431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 AC123035.1-201ENSMUST00000213846 2671 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm26075-201ENSMUST00000104062 121 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm25879-201ENSMUST00000104330 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Rabgef1Q9JM13 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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