Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm24907-201ENSMUST00000116932 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm43810-201ENSMUST00000201018 232 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 4930431P19Rik-201ENSMUST00000207570 451 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Zbed3Q9D0L1 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm24517-201ENSMUST00000122560 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm9732-201ENSMUST00000111874 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm22236-201ENSMUST00000157093 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm26024-201ENSMUST00000158657 322 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Crisp1-201ENSMUST00000026498 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Obox4-ps2-201ENSMUST00000185088 442 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Igkv4-65-201ENSMUST00000196986 358 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Olfr987-201ENSMUST00000099929 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Trav5n-3-201ENSMUST00000164511 270 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm29657-201ENSMUST00000189807 342 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm44449-201ENSMUST00000203610 153 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 Gm45355-201ENSMUST00000211342 296 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Zbed3Q9D0L1 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms