Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm28214-201ENSMUST00000185663 420 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm28560-201ENSMUST00000186091 315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm28334-201ENSMUST00000186653 315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm28495-201ENSMUST00000188452 315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm28232-201ENSMUST00000188683 315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm28481-201ENSMUST00000189231 315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm29059-201ENSMUST00000191534 315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm37765-201ENSMUST00000192395 315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm37237-201ENSMUST00000192893 315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm36968-201ENSMUST00000193737 315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm38290-201ENSMUST00000195238 315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Ccdc47Q9D024 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm27722-201ENSMUST00000183908 76 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm28058-201ENSMUST00000186421 264 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm14007-201ENSMUST00000118288 210 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm37438-201ENSMUST00000192813 393 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm25051-201ENSMUST00000158602 249 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Ccdc47Q9D024 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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