Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 AC154576.2-202ENSMUST00000223916 688 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm8074-201ENSMUST00000095071 252 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm26140-201ENSMUST00000103807 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm25718-201ENSMUST00000158632 118 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm22908-201ENSMUST00000177620 110 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm29602-201ENSMUST00000186887 442 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm18384-201ENSMUST00000195974 808 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Olfr1202-202ENSMUST00000214703 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 D3Ertd254e-201ENSMUST00000165956 6503 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Csn1s2b-202ENSMUST00000101057 1668 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm22621-201ENSMUST00000179678 74 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Mir6383-201ENSMUST00000184545 116 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm24729-201ENSMUST00000158225 137 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm37158-201ENSMUST00000191652 5704 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Dst-201ENSMUST00000097785 23251 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Apobec3Q99J72 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms