Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Ranbp2-ps2-201ENSMUST00000184379 370 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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Atg4aQ8C9S8 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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Atg4aQ8C9S8 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm26246-201ENSMUST00000178388 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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Atg4aQ8C9S8 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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Atg4aQ8C9S8 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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Atg4aQ8C9S8 Snord116l6-201ENSMUST00000179955 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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Atg4aQ8C9S8 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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Atg4aQ8C9S8 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Nbdy-205ENSMUST00000208235 132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Atg4aQ8C9S8 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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