Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm26186-201ENSMUST00000157689 125 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm24197-201ENSMUST00000175085 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC0.35□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm23969-201ENSMUST00000083324 74 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Vmn2r-ps100-201ENSMUST00000221238 1702 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
NipblQ6KCD5 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.32□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm22234-201ENSMUST00000174906 65 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Mir6964-201ENSMUST00000200252 59 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 1700072O05Rik-201ENSMUST00000204672 321 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 CT025525.3-201ENSMUST00000228858 366 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Mir670-201ENSMUST00000102380 100 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm17521-201ENSMUST00000165345 468 ntAPPRIS P1 BASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm23812-201ENSMUST00000175156 84 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm23374-201ENSMUST00000175408 84 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm43228-201ENSMUST00000200735 264 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 CT030166.2-201ENSMUST00000222021 368 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm12797-201ENSMUST00000118645 273 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm20561-201ENSMUST00000188131 292 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.3□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm29647-201ENSMUST00000188795 666 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
NipblQ6KCD5 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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