Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

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Length 425 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Mrgprb1-203ENSMUST00000188918 435 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 Gm25698-201ENSMUST00000082897 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Rbbp4Q60972 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Vmn1r-ps23-201ENSMUST00000175708 295 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm23186-201ENSMUST00000180078 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Olfr942-ps1-201ENSMUST00000215640 662 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm43626-201ENSMUST00000198575 162 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm14843-201ENSMUST00000119596 212 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm32222-201ENSMUST00000203296 298 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Rbbp4Q60972 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms