Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm45296-201ENSMUST00000209625 205 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 4930486I03Rik-201ENSMUST00000161509 788 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Olfr192-203ENSMUST00000206214 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Olfr183-201ENSMUST00000073320 2040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 CT025552.1-201ENSMUST00000224561 521 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm12801-201ENSMUST00000153228 263 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Smim9-203ENSMUST00000165080 414 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC0.65□□□□□ -2.3
Sft2d1Q5SSN7 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC0.65□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm12591-201ENSMUST00000122407 1177 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm21089-201ENSMUST00000215843 325 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Sft2d1Q5SSN7 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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