Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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Rnf40Q3U319 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
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Rnf40Q3U319 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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Rnf40Q3U319 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rnf40Q3U319 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rnf40Q3U319 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Rnf40Q3U319 Vmn1r45-203ENSMUST00000227122 2861 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Rnf40Q3U319 Vmn1r89-202ENSMUST00000226717 4120 ntAPPRIS P2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Rnf40Q3U319 Gpr34-202ENSMUST00000096492 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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