Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22823-201ENSMUST00000179754 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22360-201ENSMUST00000179775 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24978-201ENSMUST00000179782 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24967-201ENSMUST00000179791 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22288-201ENSMUST00000179904 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23512-201ENSMUST00000180237 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25327-201ENSMUST00000180263 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm26058-201ENSMUST00000180294 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm27700-201ENSMUST00000185003 81 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23629-201ENSMUST00000082465 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23924-201ENSMUST00000082474 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22246-201ENSMUST00000082478 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23057-201ENSMUST00000082801 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm26331-201ENSMUST00000082824 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24205-201ENSMUST00000082953 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25405-201ENSMUST00000082973 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22628-201ENSMUST00000082988 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm26324-201ENSMUST00000083073 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm26496-201ENSMUST00000083150 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm26127-201ENSMUST00000083193 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24456-201ENSMUST00000083198 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24458-201ENSMUST00000083204 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24018-201ENSMUST00000083232 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25790-201ENSMUST00000083293 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22295-201ENSMUST00000083311 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25127-201ENSMUST00000083336 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25583-201ENSMUST00000083413 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25577-201ENSMUST00000083414 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24414-201ENSMUST00000083434 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24861-201ENSMUST00000083459 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24803-201ENSMUST00000083693 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23103-201ENSMUST00000083725 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22580-201ENSMUST00000083727 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24260-201ENSMUST00000083741 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm23732-201ENSMUST00000083751 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22682-201ENSMUST00000083854 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm25869-201ENSMUST00000083855 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24693-201ENSMUST00000083885 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm26317-201ENSMUST00000083894 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22798-201ENSMUST00000083992 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm26427-201ENSMUST00000093648 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm22170-201ENSMUST00000097247 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Trim71Q1PSW8 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm24885-201ENSMUST00000158783 270 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Trim71Q1PSW8 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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