Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Csmd3-209ENSMUST00000162830 13012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Defa-ps9-201ENSMUST00000118264 276 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm12335-201ENSMUST00000119738 327 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm44337-201ENSMUST00000196553 114 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Spink1-201ENSMUST00000025381 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm24152-201ENSMUST00000082764 163 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Olfr1484-202ENSMUST00000208104 3621 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm31592-201ENSMUST00000217529 3471 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm7145-201ENSMUST00000185381 1794 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Olfr392-201ENSMUST00000118463 3643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 n-R5s68-201ENSMUST00000122639 82 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm5175-202ENSMUST00000219699 529 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm4788-203ENSMUST00000111989 3187 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 AC153150.1-201ENSMUST00000226065 3782 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Olfr109-204ENSMUST00000217602 5437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Ddx60-201ENSMUST00000070631 6535 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
ptchd1Q14B62 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Cd59b-204ENSMUST00000111132 436 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm15377-201ENSMUST00000119594 246 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm15461-201ENSMUST00000143488 235 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm45031-201ENSMUST00000206800 288 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Csmd3-204ENSMUST00000160658 12460 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm15669-201ENSMUST00000147834 526 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm22337-201ENSMUST00000157721 132 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm16303-201ENSMUST00000161498 390 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
ptchd1Q14B62 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms