| Hoxd1 | Q01822 | Gm44072-201 | ENSMUST00000203666 | 383 nt | TSL 3 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC163033.1-201 | ENSMUST00000218608 | 157 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC130821.1-201 | ENSMUST00000221997 | 293 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Defb9-201 | ENSMUST00000057076 | 310 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Snora23-201 | ENSMUST00000082517 | 184 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Snora7a-201 | ENSMUST00000082629 | 140 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm22739-201 | ENSMUST00000083437 | 160 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr298-203 | ENSMUST00000216968 | 3451 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr109-203 | ENSMUST00000214938 | 5550 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olr1-201 | ENSMUST00000032265 | 3572 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Cyp3a41b-201 | ENSMUST00000075837 | 2064 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Vmn2r49-201 | ENSMUST00000108550 | 2559 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Btbd35f3-201 | ENSMUST00000140300 | 1943 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr776-202 | ENSMUST00000213512 | 3499 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Trav6-7-dv9-201 | ENSMUST00000103638 | 379 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm14825-201 | ENSMUST00000113538 | 701 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm12805-201 | ENSMUST00000117305 | 1048 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm13096-201 | ENSMUST00000127752 | 251 nt | TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm12272-201 | ENSMUST00000138136 | 333 nt | TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm25220-201 | ENSMUST00000157546 | 95 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm24085-201 | ENSMUST00000175172 | 116 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm22367-201 | ENSMUST00000178930 | 132 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
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| Hoxd1 | Q01822 | Mir6405-201 | ENSMUST00000184584 | 124 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm29183-201 | ENSMUST00000188600 | 790 nt | TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
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| Hoxd1 | Q01822 | Gm19177-201 | ENSMUST00000204520 | 613 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm8940-201 | ENSMUST00000212585 | 219 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC157352.1-201 | ENSMUST00000222762 | 303 nt | TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
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| Hoxd1 | Q01822 | CT009604.2-201 | ENSMUST00000225531 | 377 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC158395.1-201 | ENSMUST00000227206 | 452 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1132-202 | ENSMUST00000216082 | 3260 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm37788-201 | ENSMUST00000193958 | 2705 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr881-202 | ENSMUST00000212489 | 4237 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1126-202 | ENSMUST00000213366 | 1827 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Tlr3-202 | ENSMUST00000167106 | 4093 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1245-202 | ENSMUST00000217402 | 2610 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Fam111a-203 | ENSMUST00000144662 | 3912 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Trbj1-4-201 | ENSMUST00000103287 | 51 nt | APPRIS P1 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm26423-201 | ENSMUST00000104277 | 128 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm23609-201 | ENSMUST00000104542 | 127 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Mir875-201 | ENSMUST00000104698 | 78 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Cypt15-201 | ENSMUST00000115114 | 519 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm13343-201 | ENSMUST00000116474 | 105 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm14841-201 | ENSMUST00000121067 | 758 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Uqcrh-ps2-201 | ENSMUST00000121613 | 269 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm8840-201 | ENSMUST00000122454 | 386 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm26256-201 | ENSMUST00000122499 | 186 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm23791-201 | ENSMUST00000122553 | 293 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm24839-201 | ENSMUST00000122602 | 107 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm23557-201 | ENSMUST00000157820 | 138 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm24858-201 | ENSMUST00000158058 | 323 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm23704-201 | ENSMUST00000158844 | 340 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Snrpe-203 | ENSMUST00000166291 | 360 nt | TSL 3 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm17224-201 | ENSMUST00000171429 | 500 nt | TSL 3 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm3370-201 | ENSMUST00000171785 | 500 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
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| Hoxd1 | Q01822 | Gm27694-201 | ENSMUST00000184740 | 86 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
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| Hoxd1 | Q01822 | Gm45826-201 | ENSMUST00000212226 | 265 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm23055-201 | ENSMUST00000082805 | 94 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm23136-201 | ENSMUST00000083425 | 99 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Vmn1r80-205 | ENSMUST00000227755 | 10455 nt | APPRIS P1 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr849-202 | ENSMUST00000217273 | 6140 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | AC121598.3-201 | ENSMUST00000227179 | 1643 nt | BASIC | 3 | □□□□□ -1.93 | | |
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| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1325-202 | ENSMUST00000216007 | 3617 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Olfr1109-202 | ENSMUST00000214636 | 2483 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | 2810403D21Rik-202 | ENSMUST00000124329 | 1660 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm22590-201 | ENSMUST00000104247 | 128 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm15010-201 | ENSMUST00000117153 | 407 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm13378-201 | ENSMUST00000117483 | 336 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm13457-201 | ENSMUST00000117885 | 267 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
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| Hoxd1 | Q01822 | Defa-ps5-201 | ENSMUST00000121541 | 279 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
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| Hoxd1 | Q01822 | Gm14298-201 | ENSMUST00000139032 | 237 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm16356-201 | ENSMUST00000143300 | 169 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | Gm22114-201 | ENSMUST00000177756 | 107 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
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| Hoxd1 | Q01822 | AC133498.1-206 | ENSMUST00000223254 | 385 nt | TSL 5 BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | CT010454.1-201 | ENSMUST00000225975 | 265 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |
| Hoxd1 | Q01822 | 1700019M22Rik-201 | ENSMUST00000073560 | 354 nt | BASIC | 2.99 | □□□□□ -1.93 | | |