Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Snora7a-201ENSMUST00000082629 140 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Olfr298-203ENSMUST00000216968 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Btbd35f3-201ENSMUST00000140300 1943 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm22367-201ENSMUST00000178930 132 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm26585-201ENSMUST00000180890 630 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 AC157352.1-201ENSMUST00000222762 303 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Mir875-201ENSMUST00000104698 78 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Cypt15-201ENSMUST00000115114 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm27694-201ENSMUST00000184740 86 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm29665-201ENSMUST00000191457 528 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC3□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm22590-201ENSMUST00000104247 128 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm13457-201ENSMUST00000117885 267 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Defa-ps5-201ENSMUST00000121541 279 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm14298-201ENSMUST00000139032 237 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm16356-201ENSMUST00000143300 169 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm22114-201ENSMUST00000177756 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm29147-201ENSMUST00000186846 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm29227-201ENSMUST00000187139 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm29034-201ENSMUST00000188099 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm28160-201ENSMUST00000191229 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm37129-201ENSMUST00000195791 315 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 Gm45313-201ENSMUST00000210584 178 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Hoxd1Q01822 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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