Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mir3103-201ENSMUST00000175474 67 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC117226.1-201ENSMUST00000221635 3737 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm6587-201ENSMUST00000120219 613 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 A630081D01Rik-201ENSMUST00000195842 1833 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Mir466n-201ENSMUST00000104798 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Rpl28P41105 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC1.09□□□□□ -2.23
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